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烟草扭脉病毒云南分离物rtp基因克隆及序列分析

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杨亚辉, 杨洁, 陈平, 等. 烟草扭脉病毒云南分离物rtp基因克隆及序列分析[J]. 植物医学, 2024, (2): 38-48. doi: 10.13718/j.cnki.zwyx.2024.02.005
引用本文: 杨亚辉, 杨洁, 陈平, 等. 烟草扭脉病毒云南分离物rtp基因克隆及序列分析[J]. 植物医学, 2024, (2): 38-48. doi: 10.13718/j.cnki.zwyx.2024.02.005
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YANG Yahui, YANG Jie, CHEN Ping, et al. Cloning and Sequencing Analysis of the Readthrough Protein Gene of Different Tobacco Vein Distorting Virus Isolates of Yunnan Province[J]. PLANT HEALTH AND MEDICINE, 2024, (2): 38-48. doi: 10.13718/j.cnki.zwyx.2024.02.005
Citation: YANG Yahui, YANG Jie, CHEN Ping, et al. Cloning and Sequencing Analysis of the Readthrough Protein Gene of Different Tobacco Vein Distorting Virus Isolates of Yunnan Province[J]. PLANT HEALTH AND MEDICINE, 2024, (2): 38-48. doi: 10.13718/j.cnki.zwyx.2024.02.005
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烟草扭脉病毒云南分离物rtp基因克隆及序列分析

  • 云南农业大学 植物保护学院, 昆明 650201

详细信息
    作者简介:

    杨亚辉， 硕士， 主要从事植物病毒学研究. .

  • 中图分类号: S435.72

Cloning and Sequencing Analysis of the Readthrough Protein Gene of Different Tobacco Vein Distorting Virus Isolates of Yunnan Province

  • College of Plant Protection, Yunnan Agricultural University, Kunming 650201, China

  • 摘要: 探究来自云南不同时间和不同地区的烟草扭脉病毒(TVDV)各分离物间rtp基因序列差异， 分析烟草丛顶病近年在田间发生趋势减缓的原因. 以2020—2022年从云南楚雄、 大理、 保山及红河采集的染病烟草样品为材料， 对TVDV的rtp基因进行扩增和序列分析， 共得到TVDV 7个不同分离物的rtp基因序列， 长度均为2 172 nt， 包含618 nt的cp基因及1 554 nt的rtd区； 推导的TVDVRTP蛋白共编码722个氨基酸， 其中包含CP蛋白的205个氨基酸， RTD的517个氨基酸. 多重序列比对结果发现， 获得的7个TVDV分离物与GenBank上登录的其他TVDV分离物间cp基因核苷酸序列一致性为98.71%～100%， 不同TVDV分离物间CP蛋白的氨基酸序列一致性为98.05%～100%， 存在4个氨基酸的差异. 获得的7个TVDV分离物与GenBank数据库登录的其他TVDV分离物间rtd区核苷酸序列一致性为96.68%～99.81%， RTD蛋白的氨基酸序列一致性为96.52%～100%， 存在39个氨基酸的差异. 这些TVDV分离物rtp基因的变异可能会对TVDV的蚜虫传播效率产生影响， 进而影响到烟草丛顶病在田间的发生与流行.
    Abstract: In order to explore the variationsinthe readthrough protein gene (rtp gene) sequencesamong isolates of tobacco vein distorting virus (TVDV) collected at different times and from various regions of Yunnan Province， and analyze the factors contributing to the recent deceleration of tobacco bush top diseasein the field， the rtp gene sequences of TVDV was cloned and analyzed from the diseased tobacco samples collected from Chuxiong， Dali， Baoshan and HongheAutonomous Prefectures/City in Yunnan Province from 2020 to 2022. The rtp gene sequences of seven different TVDV isolates were obtained， all of them were 2 172 nucleotide (nt) in length， consisting of a 618-ntcp gene and 1 554-ntrtd domain. Consequently， the TVDV RTP protein has a total of 722 amino acids (aa)， comprising 205 aa of CP protein and 517 aa of RTD. Multiple alignment analysis results showed that the nt sequence identities of the cp genebetween the seven TVDV isolates obtained in this study and the TVDV isolates registered in GenBank were 98.71%～100%. Similarly， the aa sequence identities of the CP protein among different TVDV isolates were 98.05%～100%， with four aavariations. The nt sequence identities of the rtddomain between the seven TVDV isolates obtained in this study and the TVDV isolates derived fromGenBankranged from 96.68% to 99.81%. Likewise， the aa sequence identities of their RTD domain were 96.52%～100%， with thirty-nine aa differences.The variation of rtp gene in these TVDV isolates may affect the efficiency of aphid transmission of TVDV， and thus affect the occurrence and prevalence of tobacco bush top disease in the field.
  • 加载中
  • [1] MO X H， CHEN Z B， CHEN J P. Complete Nucleotide Sequence and Genome Organization of a Chinese Isolate of Tobacco Vein Distorting Virus [J]. Virus Genes， 2010， 41(3):425-431.
    [2] MO X H， CHEN Z B， CHEN J P. Molecular Identification and Phylogenetic Analysis of a Viral RNA Associated with the Chinese Tobacco Bushy Top Disease Complex [J]. Annals of Applied Biology， 2011， 158(2):188-193.
    [3] 尹朝先， 包娜， 冉志伟， 等. TBTV卫星RNA不同分离物的序列测定及系统进化分析 [J]. 云南农业大学学报(自然科学版)， 2010， 25(6):797-801.
    [4] MO X H， QIN X Y， TAN Z X， et al. First Report of Tobacco Bushy Top Disease in China [J]. Plant Disease， 2002， 86(1):74.
    [5] CHEN X J， LUO H M， ZHANG J Y， et al. Synergism among the Four Tobacco Bushy Top Disease Casual Agents in Symptom Induction and Aphid Transmission [J]. Frontiers in Microbiology， 2022， 13:846857.
    [6] 李凡， 吴建宇， 陈海如. 烟草丛顶病研究进展 [J]. 植物病理学报， 2005， 35(5):385-391.
    [7] GATES L F. A Virus Causing Axillary Bud Sprouting of Tobacco in Rhodesia and Nyasaland [J]. Annals of Applied Biology， 1962， 50(1):169-174.
    [8] XU Y， JU H J， DEBLASIO S， et al. A Stem-Loop Structure in Potato Leafroll Virus Open Reading Frame 5 (ORF5) is Essential for Readthrough Translation of the Coat Protein ORF Stop Codon 700 Bases Upstream [J]. Journal of Virology， 2018， 92(11):15-17.
    [9] BRAULT V， VAN DEN HEUVEL J F， VERBEEK M， et al. Aphid Transmission of Beet Western Yellows LuteovirusRequires the Minor Capsid Read-through Protein P74 [J]. The EMBO Journal， 1995， 14(4):650-659.
    [10] LUCAS G B. Diseases of Tobacco[J]. Quarterly Review of Biology， 1965， 45(48):1421.
    [11] BRAULT V， HERRBACH ?， REINBOLD C. Electron Microscopy Studies on Luteovirid Transmission by Aphids [J]. Micron， 2007， 38(3):302-312.
    [12] BRAULT V， MUTTERER J， SCHEIDECKER D， et al. Effects of Point Mutations in the Readthrough Domain of the Beet Western Yellows Virus Minor Capsid Protein on Virus Accumulation in Planta and on Transmission by Aphids [J]. Journal of Virology， 2000， 74(3):1140-1148.
    [13] BRUYōRE A， BRAULT V， ZIEGLER-GRAFF V， et al. Effects of Mutations in the Beet Western Yellows Virus Readthrough Protein on Its Expression and Packaging and on Virus Accumulation， Symptoms， and Aphid Transmission [J]. Virology， 1997， 230(2):323-334.
    [14] BRAULT V， BERGDOLL M， MUTTERER J， et al. Effects of Point Mutations in the Major Capsid Protein of Beet Western Yellows Virus on Capsid Formation， Virus Accumulation， and Aphid Transmission [J]. Journal of Virology， 2003， 77(5):3247-3256.
    [15] CHAY C A， GUNASINGE U B， DINESH-KUMAR S P， et al. Aphid Transmission and Systemic Plant Infection Determinants of Barley Yellow Dwarf Luteovirus-PAV are Contained in the Coat Protein Readthrough Domain and 17-kDa Protein， Respectively [J]. Virology， 1996， 219(1):57-65.
    [16] LUCAS W J. Plant Viral Movement Proteins:Agents for Cell-to-Cell Trafficking of Viral Genomes [J]. Virology， 2006， 344(1):169-184.
    [17] LI R， MOCK R， HUANG Q， et al. A Reliable and Inexpensive Method of Nucleic Acid Extraction for the PCR-Based Detection of Diverse Plant Pathogens [J]. Journal of Virological Methods， 2008， 154(1-2):48-55.
    [18] 魏太云， 林含新， 谢联辉. 植物病毒分子群体遗传学研究进展 [J]. 福建农业大学学报， 2003， 32(4):453-457.
    [19] GARCÍA-ARENAL F， FRAILE A， MALPICA J M. Variation and Evolution of Plant Virus Populations [J]. International Microbiology， 2003， 6(4):225-232.
    [20] TAN S T， LIU F， LV J， et al. Identification of Two Novel Poleroviruses and the Occurrence of Tobacco Bushy Top Disease Causal Agents in Natural Plants [J]. Scientific Reports， 2021， 11:21045.
    [21] LI Y Y， LIU Q L， XIANG D， et al. First Report of Natural Infection of Tobacco Bushy Top Virus on Tomato and Pepper in China [J]. Plant Disease， 2018， 102(7):1466.
    [22] 杨馨， 孟鈺， 李梅蓉， 等. 云南三七病毒病的发生及病毒种类检测 [J]. 植物病理学报， 2019， 49(4):456-464.
    [23] 马普权， 刘芳， 谭冠林， 等. 云南烟草丛顶病复合病原物的寄主范围 [J]. 云南农业大学学报(自然科学)， 2015， 30(3):363-368.
    [24] ZHAO W， XU Z T， ZHANG X M， et al. Genomic Variations in the 3’-Termini of Rice Stripe Virus in the Rotation between Vector Insect and Host Plant [J]. New Phytologist， 2018， 219(3):1085-1096.
    [25] YANG X L， WANG B， LUAN J B， et al. Molecular Variation of Tomato Yellow Leaf Curl Virus in the Insect Vector BemisiaTabaci [J]. Scientific Reports， 2017， 7:16427.
    [26] ROOSSINCK M J. Mechanisms of Plantvirus Evolution [J]. Annual Review of Phytopathology， 1997， 35:191-209.
    [27] BEACHY R N， LOESCH-FRIES S， TUMER N E. Coat Protein-Mediated Resistance Against Virus Infection [J]. Annual Review of Phytopathology， 1990， 28:451-472.
    [28] GADHAVE K R， GAUTAM S， RASMUSSEN D A， et al. Aphid Transmission of Potyvirus:The Largest Plant-Infecting RNA Virus Genus [J]. Viruses， 2020， 12(7):773.
    [29] PETER K A， GILDOW F， PALUKAITIS P， et al. The C Terminus of the Polerovirus P5 Readthrough Domain Limits Virus Infection to the Phloem [J]. Journal of Virology， 2009， 83(11):5419-5429.
    [30] 杨程. 云南烟区烟草病虫害的立体防治 [J]. 植物医学， 2022， 1(3):18-24.
    [31] 熊锋， 吴维， 毛倩卓， 等. 利用免疫荧光标记技术分析TVDV在介体蚜虫消化道内的分布 [J]. 云南农业大学学报(自然科学)， 2018， 33(2):208-212.
    [32] 张振甲， 王德亚， 于成明， 等. 2种类型的烟草扭脉病毒外壳蛋白基因的序列和结构分析 [J]. 植物病理学报， 2016， 46(2):241-246.
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出版历程
  • 收稿日期:  2023-12-19

烟草扭脉病毒云南分离物rtp基因克隆及序列分析

    作者简介: 杨亚辉， 硕士， 主要从事植物病毒学研究.
  • 云南农业大学 植物保护学院, 昆明 650201
  • 收稿日期:  2023-12-19
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摘要: 探究来自云南不同时间和不同地区的烟草扭脉病毒(TVDV)各分离物间rtp基因序列差异， 分析烟草丛顶病近年在田间发生趋势减缓的原因. 以2020—2022年从云南楚雄、 大理、 保山及红河采集的染病烟草样品为材料， 对TVDV的rtp基因进行扩增和序列分析， 共得到TVDV 7个不同分离物的rtp基因序列， 长度均为2 172 nt， 包含618 nt的cp基因及1 554 nt的rtd区； 推导的TVDVRTP蛋白共编码722个氨基酸， 其中包含CP蛋白的205个氨基酸， RTD的517个氨基酸. 多重序列比对结果发现， 获得的7个TVDV分离物与GenBank上登录的其他TVDV分离物间cp基因核苷酸序列一致性为98.71%～100%， 不同TVDV分离物间CP蛋白的氨基酸序列一致性为98.05%～100%， 存在4个氨基酸的差异. 获得的7个TVDV分离物与GenBank数据库登录的其他TVDV分离物间rtd区核苷酸序列一致性为96.68%～99.81%， RTD蛋白的氨基酸序列一致性为96.52%～100%， 存在39个氨基酸的差异. 这些TVDV分离物rtp基因的变异可能会对TVDV的蚜虫传播效率产生影响， 进而影响到烟草丛顶病在田间的发生与流行.

English Abstract

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