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基于RAPD和SRAP分子标记的柑桔大实蝇种群多态性及其亲缘关系研究

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刘浩强,张云飞,李鸿筠,冉春,胡军华,姚廷山,王进军,赵志模. 基于RAPD和SRAP分子标记的柑桔大实蝇种群多态性及其亲缘关系研究[J]. 西南大学学报(自然科学版), 2014, 36(11): 049-056. doi: :10.13718/j.cnki.xdzk.2014.11.007
引用本文: 刘浩强,张云飞,李鸿筠,冉春,胡军华,姚廷山,王进军,赵志模. 基于RAPD和SRAP分子标记的柑桔大实蝇种群多态性及其亲缘关系研究[J]. 西南大学学报(自然科学版), 2014, 36(11): 049-056. doi: :10.13718/j.cnki.xdzk.2014.11.007
Citation:

基于RAPD和SRAP分子标记的柑桔大实蝇种群多态性及其亲缘关系研究

  • 摘要: 目的:利用RAPD(Random AmplifiedpolymorphicDNA)和SRAP(Sequence-RelatedAmplifiedPolymorphism)分子标记技术,研究来自重庆、湖北、四川和陕西4省市10个地理种群柑桔大实蝇的亲缘关系.方法:利用10条RAPD引物和5对SRAP引物对10个不同地理种群柑桔大实蝇的基因组DNA 进行扩增,统计多态性谱带,然后运用DPS统计分析软件进行遗传多态性及聚类分析.结果:10条RAPD 引物扩增产生152条清晰稳定的谱带,其中多态性谱带132条,多态性谱带的比例为86.84%;不同地理种群间的遗传距离在0.2500~0.6250之间,10个地理种群的柑桔大实蝇被划分为4个大类群.5对SRAP引物扩增共获得66条重复性好的清晰谱带,其中多态性谱带60条,多态性谱带比例为90.91%,不同地理种群间的遗传距离在0.2000~0.7895之间,10个地理种群的柑桔大实蝇被分为5个大的类群.将RAPD和SRAP两种标记的数据整合,聚类结果显示,10个地理种群的柑桔大实蝇被划分为6个大类群.结论:柑桔大实蝇不同地理种群间具有丰富的遗传多样性,两种方法结合分析更能准确地反映不同地理种群间的亲缘关系.
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出版历程

基于RAPD和SRAP分子标记的柑桔大实蝇种群多态性及其亲缘关系研究

  • 1. 中国农业科学院柑桔研究所/西南大学柑桔研究所,400712;2. 西南大学植物保护学院,重庆400715

摘要: 目的:利用RAPD(Random AmplifiedpolymorphicDNA)和SRAP(Sequence-RelatedAmplifiedPolymorphism)分子标记技术,研究来自重庆、湖北、四川和陕西4省市10个地理种群柑桔大实蝇的亲缘关系.方法:利用10条RAPD引物和5对SRAP引物对10个不同地理种群柑桔大实蝇的基因组DNA 进行扩增,统计多态性谱带,然后运用DPS统计分析软件进行遗传多态性及聚类分析.结果:10条RAPD 引物扩增产生152条清晰稳定的谱带,其中多态性谱带132条,多态性谱带的比例为86.84%;不同地理种群间的遗传距离在0.2500~0.6250之间,10个地理种群的柑桔大实蝇被划分为4个大类群.5对SRAP引物扩增共获得66条重复性好的清晰谱带,其中多态性谱带60条,多态性谱带比例为90.91%,不同地理种群间的遗传距离在0.2000~0.7895之间,10个地理种群的柑桔大实蝇被分为5个大的类群.将RAPD和SRAP两种标记的数据整合,聚类结果显示,10个地理种群的柑桔大实蝇被划分为6个大类群.结论:柑桔大实蝇不同地理种群间具有丰富的遗传多样性,两种方法结合分析更能准确地反映不同地理种群间的亲缘关系.

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