柑橘溃疡病相关基因CitEX3的克隆与表达分析

段敏杰,陈善春,周鹏飞,陈敏,许兰珍,彭爱红,何永睿,邹修平

doi:10.13718/j.cnki.xsxb.2016.05.038

西南师范大学学报(自然科学版)

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柑橘溃疡病相关基因CitEX3的克隆与表达分析

段敏杰,陈善春,周鹏飞,陈敏,许兰珍,彭爱红,何永睿,邹修平. 柑橘溃疡病相关基因CitEX3的克隆与表达分析[J]. 西南师范大学学报(自然科学版), 2016, 41(5). doi: 10.13718/j.cnki.xsxb.2016.05.038

引用本文:

西南大学柑橘研究所/中国农业科学院柑橘研究所/国家柑橘品种改良中心/柑橘学重庆市级重点实验室,重庆,400712. On Cloning and Expression Analysis of a Citrus Canker-Related Gene CitEX3[J]. Journal of Southwest China Normal University(Natural Science Edition), 2016, 41(5). doi: 10.13718/j.cnki.xsxb.2016.05.038

Citation:

西南大学柑橘研究所/中国农业科学院柑橘研究所/国家柑橘品种改良中心/柑橘学重庆市级重点实验室,重庆,400712. On Cloning and Expression Analysis of a Citrus Canker-Related Gene CitEX3[J]. Journal of Southwest China Normal University(Natural Science Edition), 2016, 41(5). doi: 10.13718/j.cnki.xsxb.2016.05.038

柑橘溃疡病相关基因CitEX3的克隆与表达分析

段敏杰,陈善春,周鹏飞,陈敏,许兰珍,彭爱红,何永睿,邹修平

西南师范大学学报(自然科学版) ? ISTICPKU

On Cloning and Expression Analysis of a Citrus Canker-Related Gene CitEX3

西南大学柑橘研究所/中国农业科学院柑橘研究所/国家柑橘品种改良中心/柑橘学重庆市级重点实验室,重庆,400712

摘要: 利用RT-PCR和PCR扩增技术,获得纽荷尔脐橙富亮氨酸重复序列受体样蛋白激酶EXS(EXTRA SPOROGENOUS CELLS)基因CDs全长,命名为CitEX3.生物信息学分析表明,该基因CDs全长2 667 bp,编码888个氨基酸,最大开放阅读框2 667 bp,属于富亮氨酸重复序列蛋白激酶家族(LRR-RLKs).CitEX3基因所编码蛋白EXS3分为胞外域、跨膜域和胞内激酶结构域,胞外域中存在保守的LRR重复序列,胞内激酶结构域中存在一个保守的丝/苏氨酸催化域重复序列.Southern Blot分析表明,在纽荷尔、椪柑、四季桔和金柑中该基因都以单拷贝形式存在.实时荧光定量PCR分析表明,接种溃疡病病菌后,该基因受溃疡病诱导上调表达,推测该基因可能与柑橘溃疡病抗性相关.
- Newhallnavelorange、CitEX3、LRR-RLKs、SouthernBlot、Real-timePCR

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柑橘溃疡病相关基因CitEX3的克隆与表达分析

段敏杰,陈善春,周鹏飞,陈敏,许兰珍,彭爱红,何永睿,邹修平

西南师范大学学报(自然科学版) ? ISTICPKU

关键词:

Newhallnavelorange、CitEX3、LRR-RLKs、SouthernBlot、Real-timePCR

摘要: 利用RT-PCR和PCR扩增技术,获得纽荷尔脐橙富亮氨酸重复序列受体样蛋白激酶EXS(EXTRA SPOROGENOUS CELLS)基因CDs全长,命名为CitEX3.生物信息学分析表明,该基因CDs全长2 667 bp,编码888个氨基酸,最大开放阅读框2 667 bp,属于富亮氨酸重复序列蛋白激酶家族(LRR-RLKs).CitEX3基因所编码蛋白EXS3分为胞外域、跨膜域和胞内激酶结构域,胞外域中存在保守的LRR重复序列,胞内激酶结构域中存在一个保守的丝/苏氨酸催化域重复序列.Southern Blot分析表明,在纽荷尔、椪柑、四季桔和金柑中该基因都以单拷贝形式存在.实时荧光定量PCR分析表明,接种溃疡病病菌后,该基因受溃疡病诱导上调表达,推测该基因可能与柑橘溃疡病抗性相关.