HLA-A2限制性CTL表位肽定量构效关系研究

李仁炳,胥江河,崔榕

西南师范大学学报(自然科学版)

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HLA-A2限制性CTL表位肽定量构效关系研究

李仁炳,胥江河,崔榕. HLA-A2限制性CTL表位肽定量构效关系研究[J]. 西南师范大学学报(自然科学版), 2007, 32(2).

引用本文:

李仁炳,胥江河,崔榕. HLA-A2限制性CTL表位肽定量构效关系研究[J]. 西南师范大学学报(自然科学版), 2007, 32(2).

Quantitative Structure-Activity Relationship Study on the HLA-A2 Restricted CTL Epitope[J]. Journal of Southwest China Normal University(Natural Science Edition), 2007, 32(2).

Citation:

Quantitative Structure-Activity Relationship Study on the HLA-A2 Restricted CTL Epitope[J]. Journal of Southwest China Normal University(Natural Science Edition), 2007, 32(2).

HLA-A2限制性CTL表位肽定量构效关系研究

李仁炳,胥江河,崔榕

重庆工商大学,环境与生物工程学院,重庆,400067

Quantitative Structure-Activity Relationship Study on the HLA-A2 Restricted CTL Epitope

摘要: 基于SCORE打分函数,运用定量构效关系的理论和方法研究了HLA-A2限制性CTL表位九肽结构与亲和性间的定量关系,并建立了SCORE得分与亲和性的定量关系模型,并用外部样本(5个HLA-A2限制性CTL表位九肽)作为预测集用于检验模型的预测能力.基于SCORE打分函数建立的定量模型具有较好的相关性(r=0.916 5,RMS=0.38)和对外部样本的预测能力(rpred=0.984 7,RMS=0.135).基于SCORE打分函数,运用定量构效关系研究的理论和方法建立了HLA-A2限制性CTL表位亲和性的定量预测方法,为实验鉴定高亲和性HLA-A2限制性CTL表位提供了理论依据.
- SCORE函数,CTL表位,亲和性

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HLA-A2限制性CTL表位肽定量构效关系研究

李仁炳,胥江河,崔榕

重庆工商大学,环境与生物工程学院,重庆,400067

关键词:

SCORE函数,CTL表位,亲和性

摘要: 基于SCORE打分函数,运用定量构效关系的理论和方法研究了HLA-A2限制性CTL表位九肽结构与亲和性间的定量关系,并建立了SCORE得分与亲和性的定量关系模型,并用外部样本(5个HLA-A2限制性CTL表位九肽)作为预测集用于检验模型的预测能力.基于SCORE打分函数建立的定量模型具有较好的相关性(r=0.916 5,RMS=0.38)和对外部样本的预测能力(rpred=0.984 7,RMS=0.135).基于SCORE打分函数,运用定量构效关系研究的理论和方法建立了HLA-A2限制性CTL表位亲和性的定量预测方法,为实验鉴定高亲和性HLA-A2限制性CTL表位提供了理论依据.