基于智能检测的DNA序列载体片段清除工具

李生林,谢洪涛,高黎

西南师范大学学报(自然科学版)

留言板

尊敬的读者、作者、审稿人, 关于本刊的投稿、审稿、编辑和出版的任何问题, 您可以本页添加留言。我们将尽快给您答复。谢谢您的支持!

姓名
	姓名不能为空！
邮箱
	邮箱不能为空！非法的邮箱地址。
手机号码
	电话不能为空！请输入有效手机号!
标题
	标题不能为空！
留言内容
	内容不能为空！
验证码
	验证码不能为空！验证码错误！

基于智能检测的DNA序列载体片段清除工具

李生林,谢洪涛,高黎. 基于智能检测的DNA序列载体片段清除工具[J]. 西南师范大学学报(自然科学版), 2010, 35(4).

引用本文:

李生林,谢洪涛,高黎. 基于智能检测的DNA序列载体片段清除工具[J]. 西南师范大学学报(自然科学版), 2010, 35(4).

Intelligent Detection Based on Vector Segments Removal Tool for DNA Sequence[J]. Journal of Southwest China Normal University(Natural Science Edition), 2010, 35(4).

Citation:

Intelligent Detection Based on Vector Segments Removal Tool for DNA Sequence[J]. Journal of Southwest China Normal University(Natural Science Edition), 2010, 35(4).

基于智能检测的DNA序列载体片段清除工具

李生林,谢洪涛,高黎

中国人民解放军后勤工程学院,重庆,401311

Intelligent Detection Based on Vector Segments Removal Tool for DNA Sequence

摘要: 针对传统DNA载体检测和清除工具的不足,实现一种基于智能检测的DNA载体检测新工具.该工具的核心思想是无需预先给定克隆载体序列模版、剪接位点和克隆适配片段等信息,通过建立从载体出现概率到序列权重的映射,把载体片段的检测转化为求给定序列中具有最大权重的k个不重叠相交的子序列问题,并且引入了罚函数控制避免对载体序列的过度清除.实验结果表明该工具能显著提高载体清除的效率和准确性,在超长序列处理的时候更稳定、错误率更低.
- 智能检测,载体片段,DNA序列,载体清除

计量

文章访问数: 364
HTML全文浏览数: 216
PDF下载数: 0
施引文献: 0

基于智能检测的DNA序列载体片段清除工具

李生林,谢洪涛,高黎

中国人民解放军后勤工程学院,重庆,401311

关键词:

智能检测,载体片段,DNA序列,载体清除

摘要: 针对传统DNA载体检测和清除工具的不足,实现一种基于智能检测的DNA载体检测新工具.该工具的核心思想是无需预先给定克隆载体序列模版、剪接位点和克隆适配片段等信息,通过建立从载体出现概率到序列权重的映射,把载体片段的检测转化为求给定序列中具有最大权重的k个不重叠相交的子序列问题,并且引入了罚函数控制避免对载体序列的过度清除.实验结果表明该工具能显著提高载体清除的效率和准确性,在超长序列处理的时候更稳定、错误率更低.