糖尿病肾病循环microRNA差异表达谱的分析

彭睿,查何,周吉,彭惠民,张政

doi::10.13718/j.cnki.xdzk.2014.11.011

西南大学学报（自然科学版）

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糖尿病肾病循环microRNA差异表达谱的分析

彭睿,查何,周吉,彭惠民,张政. 糖尿病肾病循环microRNA差异表达谱的分析[J]. 西南大学学报（自然科学版）, 2014, 36(11): 075-082. doi: :10.13718/j.cnki.xdzk.2014.11.011

引用本文:

彭睿,查何,周吉,彭惠民,张政. 糖尿病肾病循环microRNA差异表达谱的分析[J]. 西南大学学报（自然科学版）, 2014, 36(11): 075-082. doi: :10.13718/j.cnki.xdzk.2014.11.011

Citation:

糖尿病肾病循环microRNA差异表达谱的分析

彭睿,查何,周吉,彭惠民,张政

1. 重庆医科大学生物信息学教研室,重庆400016;2. 重庆医科大学细胞生物学及遗传学教研室,重庆400016;3. 重庆医科大学实验教学中心,重庆400016

摘要: 为了解循环microRNA在早期糖尿病肾病(Diabeticnephropathy,DN)发病机制中的作用,该文采用芯片筛查结合real-timePCR检测早期糖尿病肾病患者循环microRNA差异表达谱,同时应用生物信息学方法预测差异表达谱microRNA的靶基因.结果表明:芯片筛查出49个microRNA在DN中呈差异表达,其中信号值在两组中均大于1000的microRNA有22个,17个上调,5个下调.选择其中差异倍数大于2的5个microRNA进行realtimePCR验证,结果与芯片结果一致,分别为let-7a,let-7d,let-7f和miR-363在DN 中低表达,miR-4429在DN中高表达.同时,应用生物信息学技术预测了5个microRNA的靶基因,主要涉及细胞代谢过程调控、生长因子反应和细胞增殖等的相关基因.DN差异表达谱的建立为探寻microRNA 发病中的作用以及DN 的早期诊治提供了新的思路.
- 糖尿病肾病 /
- microRNA /
- 表达谱

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糖尿病肾病循环microRNA差异表达谱的分析

彭睿,查何,周吉,彭惠民,张政

1. 重庆医科大学生物信息学教研室,重庆400016;2. 重庆医科大学细胞生物学及遗传学教研室,重庆400016;3. 重庆医科大学实验教学中心,重庆400016

关键词:

糖尿病肾病 /
microRNA /
表达谱

摘要: 为了解循环microRNA在早期糖尿病肾病(Diabeticnephropathy,DN)发病机制中的作用,该文采用芯片筛查结合real-timePCR检测早期糖尿病肾病患者循环microRNA差异表达谱,同时应用生物信息学方法预测差异表达谱microRNA的靶基因.结果表明:芯片筛查出49个microRNA在DN中呈差异表达,其中信号值在两组中均大于1000的microRNA有22个,17个上调,5个下调.选择其中差异倍数大于2的5个microRNA进行realtimePCR验证,结果与芯片结果一致,分别为let-7a,let-7d,let-7f和miR-363在DN 中低表达,miR-4429在DN中高表达.同时,应用生物信息学技术预测了5个microRNA的靶基因,主要涉及细胞代谢过程调控、生长因子反应和细胞增殖等的相关基因.DN差异表达谱的建立为探寻microRNA 发病中的作用以及DN 的早期诊治提供了新的思路.