猪IFIT1基因的克隆、生物信息学和组织表达分析

董然然,李顺,蒋曹德

西南大学学报（自然科学版）

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猪IFIT1基因的克隆、生物信息学和组织表达分析

董然然,李顺,蒋曹德. 猪IFIT1基因的克隆、生物信息学和组织表达分析[J]. 西南大学学报（自然科学版）, 2011, 33(6).

引用本文:

董然然,李顺,蒋曹德. 猪IFIT1基因的克隆、生物信息学和组织表达分析[J]. 西南大学学报（自然科学版）, 2011, 33(6).

Cloning of IFIT1 Gene and Its Bioinformatics and Tissue Expression Analysis in Swine[J]. Journal of Southwest University Natural Science Edition, 2011, 33(6).

Citation:

Cloning of IFIT1 Gene and Its Bioinformatics and Tissue Expression Analysis in Swine[J]. Journal of Southwest University Natural Science Edition, 2011, 33(6).

猪IFIT1基因的克隆、生物信息学和组织表达分析

董然然,李顺,蒋曹德

西南大学生命科学学院,重庆,4100715

Cloning of IFIT1 Gene and Its Bioinformatics and Tissue Expression Analysis in Swine

摘要: 采用cDNA末端快速扩增(RACE)方法,对荣昌猪IFIT1基因进行克隆测序,利用生物信息学方法分析其结够和功能,并用Real-time PCR方法分析初生个体和1月龄个体11个不同组织(肺、心、肾、舌头、膀胱、卵巢、脾、肝、肌肉、胃和小肠)的表达情况.结果表明:IFIT1基因cDNA序列为1 971 bp(GenBank登录号:HQ679904),包含5'UTR 48 bp,全部CDS序列1 437 bp和3'UTR 487 bp,编码478个氨基酸,相对分子质量为55 232.9×103,等电点为6.18.其二级结构以α-螺旋和无归卷曲为主,三级结构具有典型的三角四肽和螺旋转角螺旋重复结构.荧光定量结果显示IFIT1表达量在初生个体和1月龄个体各组织间均存在着显著性差异(p＜0.01),初生个体在脾脏中的表达量高于其它各组织(p＜0.01),1月龄个体在肌肉中的表达量高于其它组织(p＜0.01).
- 猪,IFIT1,基因克隆,生物信息学,组织表达

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猪IFIT1基因的克隆、生物信息学和组织表达分析

董然然,李顺,蒋曹德

西南大学生命科学学院,重庆,4100715

关键词:

猪,IFIT1,基因克隆,生物信息学,组织表达

摘要: 采用cDNA末端快速扩增(RACE)方法,对荣昌猪IFIT1基因进行克隆测序,利用生物信息学方法分析其结够和功能,并用Real-time PCR方法分析初生个体和1月龄个体11个不同组织(肺、心、肾、舌头、膀胱、卵巢、脾、肝、肌肉、胃和小肠)的表达情况.结果表明:IFIT1基因cDNA序列为1 971 bp(GenBank登录号:HQ679904),包含5'UTR 48 bp,全部CDS序列1 437 bp和3'UTR 487 bp,编码478个氨基酸,相对分子质量为55 232.9×103,等电点为6.18.其二级结构以α-螺旋和无归卷曲为主,三级结构具有典型的三角四肽和螺旋转角螺旋重复结构.荧光定量结果显示IFIT1表达量在初生个体和1月龄个体各组织间均存在着显著性差异(p＜0.01),初生个体在脾脏中的表达量高于其它各组织(p＜0.01),1月龄个体在肌肉中的表达量高于其它组织(p＜0.01).