67份枇杷属种质资源遗传多样性的SSR分析

陈志,陈志友,龙治坚,韩国辉,党江波,王莹,汪卫星,李晓林,孙海艳,梁国鲁,向素琼

doi:10.13718/j.cnki.xdzk.2014.08.003

西南大学学报（自然科学版）

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67份枇杷属种质资源遗传多样性的SSR分析

陈志,陈志友,龙治坚,韩国辉,党江波,王莹,汪卫星,李晓林,孙海艳,梁国鲁,向素琼. 67份枇杷属种质资源遗传多样性的SSR分析[J]. 西南大学学报（自然科学版）, 2014, 36(8): 012-019. doi: 10.13718/j.cnki.xdzk.2014.08.003

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67份枇杷属种质资源遗传多样性的SSR分析

陈志,陈志友,龙治坚,韩国辉,党江波,王莹,汪卫星,李晓林,孙海艳,梁国鲁,向素琼

1. 西南大学园艺园林学院,重庆400716;2. 西南科技大学生命科学与工程学院,四川绵阳621010;3. 重庆市农业科学院果树研究所,重庆江津402260

摘要: 利用从枇杷上开发的SSR引物对67份枇杷属种质资源进行了遗传多样性分析.从59对引物中筛选出17对多态性较高且稳定的引物,17对引物共扩增出53条谱带,每对引物扩增2至6条谱带,平均扩增3.12条.供试材料相似系数介于0.53~1.00之间,平均多态信息含量(PIC)为0.436,平均观察等位基因数为3.118,平均有效等位基因数为2.166,平均Nei’s基因多样性为0.507,平均Shannon信息指数为0.821,平均观测杂合度为0.637,平均期望杂合度为0.511,表明供试材料具较丰富的遗传多样性.聚类分析表明,可将67份材料分为4类,野生品种和栽培品种在聚类结果中没有被区分开,但是绝大多数是被区分开的.栽培枇杷也没有因果肉颜色而分别聚类.此外,对野生枇杷和栽培枇杷中部分材料的分类作了探讨.
- 枇杷 /
- 种质资源 /
- 遗传多样性 /
- SSR

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67份枇杷属种质资源遗传多样性的SSR分析

陈志,陈志友,龙治坚,韩国辉,党江波,王莹,汪卫星,李晓林,孙海艳,梁国鲁,向素琼

1. 西南大学园艺园林学院,重庆400716;2. 西南科技大学生命科学与工程学院,四川绵阳621010;3. 重庆市农业科学院果树研究所,重庆江津402260

关键词:

枇杷 /
种质资源 /
遗传多样性 /
SSR

摘要: 利用从枇杷上开发的SSR引物对67份枇杷属种质资源进行了遗传多样性分析.从59对引物中筛选出17对多态性较高且稳定的引物,17对引物共扩增出53条谱带,每对引物扩增2至6条谱带,平均扩增3.12条.供试材料相似系数介于0.53~1.00之间,平均多态信息含量(PIC)为0.436,平均观察等位基因数为3.118,平均有效等位基因数为2.166,平均Nei’s基因多样性为0.507,平均Shannon信息指数为0.821,平均观测杂合度为0.637,平均期望杂合度为0.511,表明供试材料具较丰富的遗传多样性.聚类分析表明,可将67份材料分为4类,野生品种和栽培品种在聚类结果中没有被区分开,但是绝大多数是被区分开的.栽培枇杷也没有因果肉颜色而分别聚类.此外,对野生枇杷和栽培枇杷中部分材料的分类作了探讨.