用于研制柑橘DArT芯片的DNA探针文库的制备

马香;刘小刚;李利改;周志钦;

doi:10.13718/j.cnki.xdzk.2015.12.001

西南大学学报（自然科学版）

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用于研制柑橘DArT芯片的DNA探针文库的制备

马香;刘小刚;李利改;周志钦;. 用于研制柑橘DArT芯片的DNA探针文库的制备[J]. 西南大学学报（自然科学版）, 2015, 37(12). doi: 10.13718/j.cnki.xdzk.2015.12.001

引用本文:

马香;刘小刚;李利改;周志钦;. 用于研制柑橘DArT芯片的DNA探针文库的制备[J]. 西南大学学报（自然科学版）, 2015, 37(12). doi: 10.13718/j.cnki.xdzk.2015.12.001

Citation:

用于研制柑橘DArT芯片的DNA探针文库的制备

马香;刘小刚;李利改;周志钦;

西南大学园艺园林学院;

MA Xiang;LIU Xiao-gang;LI Li-gai;ZHOU Zhi-qin;School of Horticulture and Landscape Architecture,Southwest University;

摘要: 以柑橘属Swingle分类系统界定的16种柑橘物种的基因组DNA为材料,构建了研制柑橘DArT芯片的DNA探针文库,进而从中随机挑选出15 000条探针用于柑橘DArT芯片的开发.柑橘物种的基因组DNA采用改良CTAB法提取并等量混合,经Eco RI和Mse I双酶切后连接接头序列,再使用选择性引物进行PCR扩增,并将扩增产物转化大肠杆菌,构建探针文库.从探针文库中随机挑选出15 000个阳性单克隆,通过PCR扩增和纯化获得了15 000条用于制备DArT芯片的DNA探针.凝胶电泳检测显示所制备的DNA探针的纯度和浓度均满足了研制DArT芯片的要求.为采用DArT芯片快速鉴定柑橘物种并研究其进化关系奠定了基础.?更多还原
- 柑橘属 /
- DArT芯片 /
- 探针 /
- 文库

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用于研制柑橘DArT芯片的DNA探针文库的制备

马香;刘小刚;李利改;周志钦;

西南大学园艺园林学院;

关键词:

柑橘属 /
DArT芯片 /
探针 /
文库

摘要: 以柑橘属Swingle分类系统界定的16种柑橘物种的基因组DNA为材料,构建了研制柑橘DArT芯片的DNA探针文库,进而从中随机挑选出15 000条探针用于柑橘DArT芯片的开发.柑橘物种的基因组DNA采用改良CTAB法提取并等量混合,经Eco RI和Mse I双酶切后连接接头序列,再使用选择性引物进行PCR扩增,并将扩增产物转化大肠杆菌,构建探针文库.从探针文库中随机挑选出15 000个阳性单克隆,通过PCR扩增和纯化获得了15 000条用于制备DArT芯片的DNA探针.凝胶电泳检测显示所制备的DNA探针的纯度和浓度均满足了研制DArT芯片的要求.为采用DArT芯片快速鉴定柑橘物种并研究其进化关系奠定了基础.?更多还原