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河南省番茄黄化曲叶病病原分子鉴定及全基因组序列分析

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于云奇,阮涛,杨水英,周常勇,青玲. 河南省番茄黄化曲叶病病原分子鉴定及全基因组序列分析[J]. 西南大学学报(自然科学版), 2014, 36(1): 013-017.
引用本文: 于云奇,阮涛,杨水英,周常勇,青玲. 河南省番茄黄化曲叶病病原分子鉴定及全基因组序列分析[J]. 西南大学学报(自然科学版), 2014, 36(1): 013-017.
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河南省番茄黄化曲叶病病原分子鉴定及全基因组序列分析

  • 摘要: 利用双生病毒简并引物PA/PB对采自河南中牟县13份表现为黄化、曲叶症状的番茄样品进行PCR检测,结果发现11份样品检测呈阳性,检出率为84.6%.选取样品HN-158,利用滚环扩增PCR(RCA-PCR)、克隆、测序等技术获得病毒基因组DNA-A全序列,该DNA分子全长为2781nts(登录号JQ004028.1),与已报道的番茄黄花曲叶病毒Tomatoyellowleafcurlvirus,TYLCV山东泰安分离物SDTA(NCBI登录号:JF414236.1)核酸序列相似度最高,为99.8%.进化分析表明,该病毒分离物与来自菏泽、泰安、济南、石家庄及天津等地的TYLCV 分离物亲缘关系较近.以上结果表明中牟县田间番茄黄化曲叶病样品均受到TYLCV 侵染,该病毒分离物可能来源于我国山东番茄上的TYLCV.
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出版历程

河南省番茄黄化曲叶病病原分子鉴定及全基因组序列分析

  • 1. 西南大学植物保护学院,植物病害生物学重庆市高校级重点实验室,重庆400716;2. 中国农业科学院柑橘研究所,重庆400712

摘要: 利用双生病毒简并引物PA/PB对采自河南中牟县13份表现为黄化、曲叶症状的番茄样品进行PCR检测,结果发现11份样品检测呈阳性,检出率为84.6%.选取样品HN-158,利用滚环扩增PCR(RCA-PCR)、克隆、测序等技术获得病毒基因组DNA-A全序列,该DNA分子全长为2781nts(登录号JQ004028.1),与已报道的番茄黄花曲叶病毒Tomatoyellowleafcurlvirus,TYLCV山东泰安分离物SDTA(NCBI登录号:JF414236.1)核酸序列相似度最高,为99.8%.进化分析表明,该病毒分离物与来自菏泽、泰安、济南、石家庄及天津等地的TYLCV 分离物亲缘关系较近.以上结果表明中牟县田间番茄黄化曲叶病样品均受到TYLCV 侵染,该病毒分离物可能来源于我国山东番茄上的TYLCV.

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