葱蝇过氧化氢酶基因的克隆及生物信息学分析

胡甘雨,司风玲,车燕飞,张玉娟,陈斌

西南大学学报（自然科学版）

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葱蝇过氧化氢酶基因的克隆及生物信息学分析

胡甘雨,司风玲,车燕飞,张玉娟,陈斌. 葱蝇过氧化氢酶基因的克隆及生物信息学分析[J]. 西南大学学报（自然科学版）, 2014, 36(1): 032-040.

引用本文:

胡甘雨,司风玲,车燕飞,张玉娟,陈斌. 葱蝇过氧化氢酶基因的克隆及生物信息学分析[J]. 西南大学学报（自然科学版）, 2014, 36(1): 032-040.

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葱蝇过氧化氢酶基因的克隆及生物信息学分析

胡甘雨,司风玲,车燕飞,张玉娟,陈斌

重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所重庆市动物生物学重点实验室,重庆401331

摘要: 过氧化氢酶(catalase,CAT)对昆虫的生长发育和代谢活动具有重要意义,是昆虫清除H2O2 的关键酶.昆虫在滞育期间代谢速率很低,而CAT的活力与代谢强度有关,因此滞育期的昆虫是研究该酶的良好材料.本研究基于葱蝇转录组unigene序列信息,设计特异性引物并首次通过PCR技术克隆了葱蝇过氧化氢酶基因全长cDNA,命名为DaCAT,其全长为2073bp,开放阅读框1518bp,编码505个氨基酸,推测其相对分子质量为5.68×104,等电点为7.72.该研究对其进行了生物信息学分析并建立了系统发育树,分析表明该基因编码的氨基酸序列具有2个保守结构域及多个酶活性位点,与其他物种CAT具有较高的同源性,其中和拟果蝇Drosophilasimulans 亲缘关系最近,相似率为89.3%,采用SWISS-MODEL对其进行了蛋白质同源建模及3D 结构预测分析,为进一步研究DaCAT基因在葱蝇滞育期间的代谢表达、酶活力测定以及具体功能奠定了基础.
- 葱蝇 /
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葱蝇过氧化氢酶基因的克隆及生物信息学分析

胡甘雨,司风玲,车燕飞,张玉娟,陈斌

重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所重庆市动物生物学重点实验室,重庆401331

关键词:

摘要: 过氧化氢酶(catalase,CAT)对昆虫的生长发育和代谢活动具有重要意义,是昆虫清除H2O2 的关键酶.昆虫在滞育期间代谢速率很低,而CAT的活力与代谢强度有关,因此滞育期的昆虫是研究该酶的良好材料.本研究基于葱蝇转录组unigene序列信息,设计特异性引物并首次通过PCR技术克隆了葱蝇过氧化氢酶基因全长cDNA,命名为DaCAT,其全长为2073bp,开放阅读框1518bp,编码505个氨基酸,推测其相对分子质量为5.68×104,等电点为7.72.该研究对其进行了生物信息学分析并建立了系统发育树,分析表明该基因编码的氨基酸序列具有2个保守结构域及多个酶活性位点,与其他物种CAT具有较高的同源性,其中和拟果蝇Drosophilasimulans 亲缘关系最近,相似率为89.3%,采用SWISS-MODEL对其进行了蛋白质同源建模及3D 结构预测分析,为进一步研究DaCAT基因在葱蝇滞育期间的代谢表达、酶活力测定以及具体功能奠定了基础.