红豆杉香叶基香叶基焦磷酸合成酶基因克隆分析

兰小中,孙敏

西南大学学报（自然科学版）

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红豆杉香叶基香叶基焦磷酸合成酶基因克隆分析

兰小中,孙敏. 红豆杉香叶基香叶基焦磷酸合成酶基因克隆分析[J]. 西南大学学报（自然科学版）, 2006, 28(4).

引用本文:

兰小中,孙敏. 红豆杉香叶基香叶基焦磷酸合成酶基因克隆分析[J]. 西南大学学报（自然科学版）, 2006, 28(4).

CLONING AND CHARACTERIZATION OF THE GERANYLGERANYL DIPHOSPHATE SYNTHASE GENE IN TAXUS WALLICIANA[J]. Journal of Southwest University Natural Science Edition, 2006, 28(4).

Citation:

CLONING AND CHARACTERIZATION OF THE GERANYLGERANYL DIPHOSPHATE SYNTHASE GENE IN TAXUS WALLICIANA[J]. Journal of Southwest University Natural Science Edition, 2006, 28(4).

红豆杉香叶基香叶基焦磷酸合成酶基因克隆分析

兰小中,孙敏

西藏大学,农牧学院动物科技系生物技术教研室,西藏,林芝,860000,西南大学,生命科学学院,重庆,400715

CLONING AND CHARACTERIZATION OF THE GERANYLGERANYL DIPHOSPHATE SYNTHASE GENE IN TAXUS WALLICIANA

摘要: 20碳单位的香叶基香叶基焦磷酸是紫杉醇生物合成的直接前体,它由香叶基香叶基焦磷酸合成酶催化生成.采用RT-PCR技术从高原植物西藏红豆杉中克隆了编码香叶基香叶基焦磷酸合成酶基因,命名为TwGGPPS(Gen-Bank登录号:DQ 364604).该基因编码区长为1 182 bp,编码393个氨基酸的多肽;生物信息学分析表明TwGGPPS定位于质体,在其氨基端具有长为18个氨基酸的质体转运肽;TwGGPPS属于异戊烯基转运酶家族,具有该酶家族特有的2个天冬氨酸富集基序;分子系统进化分析表明植物的GGPPS分为被子植物和裸子植物2种类型,TwGGPPS属于裸子植物类型的GGPPS;对TwGGPPS的蛋白质结构模拟分析结果表明,TwGGPPS由大量的α-螺旋通过随机卷曲连接而成,这些α-螺旋环绕形成一个袋状空腔,其空腔口部为底物结合与碳链延伸的活性部位.对TwGGPPS基因组结构的分析表明该基因没有内含子.该基因的克隆和分析为实现紫杉醇的基因工程提供了一个重要的基因和作用靶点.
- 西藏红豆杉,紫杉醇,香叶基香叶基焦磷酸合成酶,基因克隆,生物信息学分析

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红豆杉香叶基香叶基焦磷酸合成酶基因克隆分析

兰小中,孙敏

西藏大学,农牧学院动物科技系生物技术教研室,西藏,林芝,860000,西南大学,生命科学学院,重庆,400715

关键词:

西藏红豆杉,紫杉醇,香叶基香叶基焦磷酸合成酶,基因克隆,生物信息学分析

摘要: 20碳单位的香叶基香叶基焦磷酸是紫杉醇生物合成的直接前体,它由香叶基香叶基焦磷酸合成酶催化生成.采用RT-PCR技术从高原植物西藏红豆杉中克隆了编码香叶基香叶基焦磷酸合成酶基因,命名为TwGGPPS(Gen-Bank登录号:DQ 364604).该基因编码区长为1 182 bp,编码393个氨基酸的多肽;生物信息学分析表明TwGGPPS定位于质体,在其氨基端具有长为18个氨基酸的质体转运肽;TwGGPPS属于异戊烯基转运酶家族,具有该酶家族特有的2个天冬氨酸富集基序;分子系统进化分析表明植物的GGPPS分为被子植物和裸子植物2种类型,TwGGPPS属于裸子植物类型的GGPPS;对TwGGPPS的蛋白质结构模拟分析结果表明,TwGGPPS由大量的α-螺旋通过随机卷曲连接而成,这些α-螺旋环绕形成一个袋状空腔,其空腔口部为底物结合与碳链延伸的活性部位.对TwGGPPS基因组结构的分析表明该基因没有内含子.该基因的克隆和分析为实现紫杉醇的基因工程提供了一个重要的基因和作用靶点.