贵州部分柑橘地方品种遗传背景的SSR分析

雷天刚,何永睿,彭爱红,许兰珍,邹修平,姚利晓,李金强,陈善春

doi:10.13718/j.cnki.xdzk.2015.11.005

西南大学学报（自然科学版）

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贵州部分柑橘地方品种遗传背景的SSR分析

雷天刚,何永睿,彭爱红,许兰珍,邹修平,姚利晓,李金强,陈善春. 贵州部分柑橘地方品种遗传背景的SSR分析[J]. 西南大学学报（自然科学版）, 2015, 37(11): 30-35. doi: 10.13718/j.cnki.xdzk.2015.11.005

引用本文:

LEI Tian-gang,HE Yong-rui,PENG Ai-hong,XU Lan-zhen,ZOU Xiu-ping,YAO Li-xiao,LI Jin-qiang,CHEN Shan-chun. Genetic Background Analysis of Several Guizhou Local Citrus Varieties Based on SSR Markers[J]. Journal of Southwest University Natural Science Edition, 2015, 37(11): 30-35. doi: 10.13718/j.cnki.xdzk.2015.11.005

Citation:

LEI Tian-gang,HE Yong-rui,PENG Ai-hong,XU Lan-zhen,ZOU Xiu-ping,YAO Li-xiao,LI Jin-qiang,CHEN Shan-chun. Genetic Background Analysis of Several Guizhou Local Citrus Varieties Based on SSR Markers[J]. Journal of Southwest University Natural Science Edition, 2015, 37(11): 30-35. doi: 10.13718/j.cnki.xdzk.2015.11.005

贵州部分柑橘地方品种遗传背景的SSR分析

雷天刚,何永睿,彭爱红,许兰珍,邹修平,姚利晓,李金强,陈善春

西南大学柑桔研究所,重庆400712; 国家柑桔品种改良中心,重庆 400712 ; 贵州省果树科学研究所,贵阳,550006

Genetic Background Analysis of Several Guizhou Local Citrus Varieties Based on SSR Markers

LEI Tian-gang,HE Yong-rui,PENG Ai-hong,XU Lan-zhen,ZOU Xiu-ping,YAO Li-xiao,LI Jin-qiang,CHEN Shan-chun

摘要: 利用SSR分子标记技术对5个贵州柑橘地方品种的遗传背景进行分析．结果表明，24对SSR引物在5个地方品种和参与D N A指纹比对的14个栽培品种中共检测到92个等位基因，每个位点的等位基因数变幅为2～7个，平均为3.8个；多态性信息含量（PIC）变化范围在0.36～0.78之间，平均为0.49．经过DNA指纹比对，发现其中5对引物扩增的8条特征谱带可作为地方品种鉴别的参考性标记．利用NTSYS软件进行相似性系数计算，采用 UP‐GM A法聚类，结果显示，相似性系数为0.80，可将5个地方品种划分在不同的亚组中；地方品种米柑和牛肉红金橘均单独成组，其遗传背景独特；土柑与皱皮柑的亲缘关系较近；大果型冰糖橙与冰糖橙的遗传背景相同；红香柚与强德勒柚的遗传背景基本一致．
- 柑橘 /
- 地方品种 /
- 遗传背景 /
- SSR标记

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贵州部分柑橘地方品种遗传背景的SSR分析

雷天刚,何永睿,彭爱红,许兰珍,邹修平,姚利晓,李金强,陈善春

西南大学柑桔研究所,重庆400712; 国家柑桔品种改良中心,重庆 400712 ; 贵州省果树科学研究所,贵阳,550006

关键词:

柑橘 /
地方品种 /
遗传背景 /
SSR标记

摘要: 利用SSR分子标记技术对5个贵州柑橘地方品种的遗传背景进行分析．结果表明，24对SSR引物在5个地方品种和参与D N A指纹比对的14个栽培品种中共检测到92个等位基因，每个位点的等位基因数变幅为2～7个，平均为3.8个；多态性信息含量（PIC）变化范围在0.36～0.78之间，平均为0.49．经过DNA指纹比对，发现其中5对引物扩增的8条特征谱带可作为地方品种鉴别的参考性标记．利用NTSYS软件进行相似性系数计算，采用 UP‐GM A法聚类，结果显示，相似性系数为0.80，可将5个地方品种划分在不同的亚组中；地方品种米柑和牛肉红金橘均单独成组，其遗传背景独特；土柑与皱皮柑的亲缘关系较近；大果型冰糖橙与冰糖橙的遗传背景相同；红香柚与强德勒柚的遗传背景基本一致．