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基于MaxEnt模型的川续断气候适宜性分析

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尧聪, 岳媛, 危永胜, 等. 基于MaxEnt模型的川续断气候适宜性分析[J]. 西南大学学报(自然科学版), 2018, 40(3): 60-67. doi: 10.13718/j.cnki.xdzk.2018.03.009
引用本文: 尧聪, 岳媛, 危永胜, 等. 基于MaxEnt模型的川续断气候适宜性分析[J]. 西南大学学报(自然科学版), 2018, 40(3): 60-67. doi: 10.13718/j.cnki.xdzk.2018.03.009
Cong YAO, Yuan YUE, Yong-sheng WEI, et al. Study of Climatic Suitability for Dipsacus asper Based on MaxEnt Model[J]. Journal of Southwest University Natural Science Edition, 2018, 40(3): 60-67. doi: 10.13718/j.cnki.xdzk.2018.03.009
Citation: Cong YAO, Yuan YUE, Yong-sheng WEI, et al. Study of Climatic Suitability for Dipsacus asper Based on MaxEnt Model[J]. Journal of Southwest University Natural Science Edition, 2018, 40(3): 60-67. doi: 10.13718/j.cnki.xdzk.2018.03.009

基于MaxEnt模型的川续断气候适宜性分析

  • 基金项目: 重庆市科技平台与基地建设项目(cstc2014ptyjd10001)
详细信息
    作者简介:

    尧聪(1992-),女,湖北咸宁人,硕士研究生,主要从事中药资源与开发研究 .

    通讯作者: 李逐波,教授
  • 中图分类号: Q949.781.5

Study of Climatic Suitability for Dipsacus asper Based on MaxEnt Model

  • 摘要: 查询相关文献、国家数字植物标本馆和全球生物多样性信息数据库,收集川续断在全国的采样信息,以温度、降雨和海拔为指标,采用MaxEnt模型软件对川续断在全国的气候适宜性进行分析.研究结果表明,MaxEnt预测模型有效性高.影响川续断适宜性分布的主要气候因子为最暖季降水量、海拔、温度季节性变化的标准差、季节降水量变异系数、年均温范围和最干季平均温,适宜的取值区间分别为最暖季降水量为500~900 mm,海拔为1 800~4 300 m,温度季节性变化的标准差为40~75,季节降水量变异系数为65~105,年均温范围为21 ℃~30 ℃,最干季平均温度为-1 ℃~9 ℃.全国可划分为4个气候适宜等级,依照p<0.25为气候不适宜区;0.25≤p<0.48为气候较适宜区;0.48≤p<0.78为气候适宜区;p≥0.78为气候最适宜区的划分标准,川续断适宜生长区域主要集中在西南地区,包括云南、西藏、四川、贵州、重庆等省市.
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  • 图 1  川续断生境适宜度ROC曲线

    图 2  川续断预测结果刀切图

    图 3  影响川续断生长的6种主要气候因子响应图

    图 4  川续断气候适宜度分布

    表 1  气候因子数据

    No. 名称 单位 类型
    bio1 年均温 摄氏度×10(℃×10) 连续型
    bio2 月均温范围 摄氏度×10(℃×10) 连续型
    bio3 等温性 1 连续型
    bio4 温度季节性变化的标准差 1 连续型
    bio5 最暖月最高温 摄氏度×10(℃×10) 连续型
    bio6 最冷月最低温 摄氏度×10(℃×10) 连续型
    bio7 年均温范围 摄氏度×10(℃×10) 连续型
    bio8 最湿季平均温 摄氏度×10(℃×10) 连续型
    bio9 最干季平均温 摄氏度×10(℃×10) 连续型
    bio10 最暖季平均温 摄氏度×10(℃×10) 连续型
    bio11 最冷季平均温 摄氏度×10(℃×10) 连续型
    bio12 年降水量 毫米(mm) 连续型
    bio13 最湿月降水量 毫米(mm) 连续型
    bio14 最干月降水量 毫米(mm) 连续型
    bio15 季节降水量变异系数 1 连续型
    bio16 最湿季降水量 毫米(mm) 连续型
    bio17 最干季降水量 毫米(mm) 连续型
    bio18 最暖季降水量 毫米(mm) 连续型
    bio19 最冷季降水量 毫米(mm) 连续型
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    表 2  全国川续断采样点信息汇总

    No. 地点 东经E/° 北纬N/° 海拔/m
    1 安徽金寨县马宗岭 115.701 9 31.278 46 3 800
    2 甘肃康县阳坝小河坝龙王坝 110.371 1 31.435 99 2100
    3 甘肃文县关口道魏家湾 104.762 32.775 11 1 624
    4 甘肃文县白马玉河草河坝 104.773 7 32.684 44 1 624
    5 广西壮族自治区隆林县金钟山 105.349 5 24.787 9 1 380
    6 广西壮族自治区那坡县德孚 105.813 7 23.333 45 1 370
    7 广西壮族自治区兴安县猫儿山 110.410 6 25.807 2 2 000
    8 贵州普安县普北林场 104.981 6 25.792 93 1 230
    9 湖北鹤峰县木林子 110.212 7 30.091 45 2 450
    10 湖北鹤峰县芹草坪 110.266 7 30.089 86 2 300
    11 湖北鹤峰县沙家坪 110.053 5 29.877 74 1 900
    12 湖北神农架林区大岩屋 109.412 6 29.512 19 2 000
    13 湖北神农架林区关门山 110.371 1 31.435 99 1 500
    14 湖北神农架林区老君山 110.484 7 31.538 12 2 250
    15 湖北咸丰县坪坝营 108.988 6 29.406 7 800
    16 湖北宜昌大老岭草帽尖 110.931 4 31.100 3 2 800
    17 湖北宜昌邓村蚂蝗沟 110.994 8 30.965 45 3 150
    18 湖北宜昌龙潭湾 110.967 2 31.066 76 3 450
    19 湖南莽山大塘坑 112.963 8 24.972 94 1 920
    20 湖南莽山相思坑 112.993 1 24.954 33 3 450
    21 湖南保靖县白云山 109.371 1 28.699 27 1 800
    22 湖南道县南竹坪榆湾冲 111.866 7 25.210 44 2 000
    23 湖南武冈县云山堂 110.625 8 26.649 44 1 600
    24 湖南新晃侗族自治县天雷山 109.4215 27.25157 1 900
    25 湖南新宁紫云山 111.097 1 26.606 4 2 200
    26 湖南宜章莽山 112.884 9 24.988 1 350
    53 西藏自治区亚东县帕里镇则里拉山 89.161 7 27.724 47 1 200
    54 西藏自治区亚东县下司马镇 88.880 66 27.493 78 2 600
    55 云南安宁市笔架山 102.464 2 24.999 9 1 200
    56 云南宾川县鸡足山 100.409 8 25.959 11 3 200
    57 云南大理市苍山花甸坝 100.038 1 25.886 72 3 500
    58 云南大理市苍山中和寺 100.137 6 25.689 49 3 600
    59 云南大理市小花甸 100.045 9 25.897 39 2 300
    60 云南德宏陇川户撒芒中 97.860 07 24.443 06 3 050
    61 云南德钦县白巴雪山 99.159 23 28.310 41 3 640
    62 云南德钦县茨中 98.909 6 28.03712 1 920
    63 云南德钦县鱼归 98.968 08 28.438 79 1 250
    64 云南洱源县牛街区马耳山 100.049 5 26.345 97 700
    65 云南福贡县碧江知子罗 98.922 54 26.544 28 750
    66 云南贡山独龙族自治县高黎贡山 98.656 36 28.027 92 1 400
    67 云南贡山独龙族自治县丹当公园 98.670 59 27.746 37 730
    68 云南贡山独龙族自治县莫切旺 98.365 02 27.903 75 1 250
    69 云南贡山独龙族自治县丙中洛 98.665 8 27.740 7 1 500
    70 云南鹤庆县松桂马耳山 100.127 2 26.243 65 3 500
    71 云南会泽县大海大黑山 103.511 6 26.576 08 3 800
    72 云南会泽县大海滴水岩 103.273 4 26.194 5 1 800
    73 云南景东彝族自治县徐家坝 101.024 1 24.545 05 800
    74 云南景东彝族自治县哀牢 100.709 8 24.615 7 1 487
    75 云南景东彝族自治县无量山黄草坡 100.482 7 24.836 6 1 300
    76 云南昆明市西山华亭寺后山 102.634 2 24.9774 1 100
    77 云南丽江县雪蒿村西山 100.229 9 26.876 1 2 445
    78 云南丽江纳西族自治县玉龙山 100.235 7 27.116 2 1 300
    27 湖南永顺县高峰坡谢家坡 109.880 8 28.979 3 3 800
    28 陕西略阳县五龙洞 106.299 33.598 8 3 600
    29 陕西眉县太白山 107.908 1 34.112 9 4 500
    30 陕西南郑县牟家坝 107.045 32.898 3 3 500
    31 陕西宁陕县新场乡菜子坪 108.344 33.748 3 2 900
    32 陕西洋县华阳 107.555 33.594 4 000
    33 四川大花乡大槽 107.550 6 33.596 5 3 900
    34 四川稻城县呷拥 100.354 8 28.565 2 3 900
    35 四川黑水县刷经寺 102.625 3 32.025 2 3 200
    36 四川金川县下塞区集沐乡 102.023 6 31.719 5 1 150
    37 四川金川县下寨区撒瓦脚乡 101.901 1 31.554 5 840
    38 四川金阳县波洛梁子 103.177 5 27.781 6 3 200
    39 四川康定县营官寨 101.542 30.023 3 3 200
    40 四川理县鹧鸪山 102.681 6 31.857 4 3 350
    41 四川冕宁县罗锅底区联合乡 101.799 6 28.191 8 3 800
    42 四川木里藏族自治县烧香梁子 101.520 9 28.168 4 2 400
    43 四川若尔盖县热尔乡热尔沟 103.089 4 34.055 6 2 850
    44 四川天全县城相区小龙岗 102.771 30.096 6 3 800
    45 四川乡城县七星岗 99.845 66 28.742 3 2 940
    46 四川盐边县大坪子 101.692 26.707 2 3 400
    47 四川盐边县箐河乡青山外坪子 101.426 8 27.073 9 2 940
    48 四川越西县大坪子 102.493 3 28.867 3 3 600
    49 西藏自治区米拉山 92.351 94 29.831 3 100
    50 西藏自治区察隅县上察隅素苦 96.784 27 28.722 9 3 200
    51 西藏自治区察隅县竹瓦根区拉拉山 97.464 95 28.664 61 3 100
    52 西藏自治区错那县吉巴乡 91.808 87 27.929 69 1 900
    79 云南丽江县黑白水云杉坪 100.249 5 27.140 8 3 000
    80 云南丽江县玉龙山白水河 100.272 6 27.14 4 000
    81 云南泸水县片古岗公社片马 98.620 59 26.014 6 3 300
    82 云南禄劝彝族苗族自治县乌蒙山 102.803 1 26.039 2 800
    83 云南罗平县白腊山 104.245 8 24.856 9 3 600
    84 云南石林彝族自治县海邑村圭山 103.400 3 24.808 9 1 900
    85 云南腾冲县曲石公社大坝斋公房西坡 98.490 0 25.020 6 1 668
    86 云南维西县碧罗雪山东坡渣子 99.287 2 27.177 2 2 308
    87 云南维西县沧怒分水岭白马洛 99.0370 5 27.766 8 1 800
    88 云南维西县岩瓦大平子驮扎乌姑 99.349 23 27.144 5 3 400
    89 云南文山县薄竹山 104.250 7 23.363 0 1 295
    90 云南永德县大雪山 99.647 59 24.114 8 3 100
    91 云南中甸县哈巴雪山 100.149 7 27.374 1 2 700
    92 云南中甸县仙人洞雪山 100.260 5 27.683 9 3 500
    93 云南中甸县小中甸 99.819 18 27.5596 2 600
    94 云南中甸县小中甸公社支梯坝 99.706 1 27.823 1 3 280
    95 重庆市南川区金佛山凤凰寺 107.196 4 29.018 3 3 300
    96 重庆市南川区白金寺 107.110 2 29.097 8 1 150
    97 重庆市南川区金佛山天城山 107.207 1 29.037 6 2 900
    98 重庆市巫山县竹贤乡罗家沟 110.078 3 31.289 7 3 100
    99 重庆市巫山县竹贤乡徐家沟 110.108 2 31.287 1 3 150
    100 重庆市武隆县仙女山 107.730 1 29.428 7 1 419
    101 重庆市武隆县仙女山后山 107.706 9 29.507 3 1 534
    102 重庆市武隆县巷口镇 107.693 5 29.335 8 1 037
    103 重庆市武隆县白马山 107.593 4 29.365 8 1 238
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    表 3  MaxEnt模型运算的气候因子贡献率表(AUC=0.994 ℃)

    变量 贡献率/% 重要性/%
    bio18 45.6 16.6
    alt 25.9 25.8
    bio4 13 6.1
    bio15 5.7 1.2
    bio7 4.4 1.1
    bio9 3.4 27.1
    bio11 1.2 9.7
    bio12 0.2 1.7
    bio14 0.1 0.7
    bio19 0.1 3.6
    bio5 0.1 1.5
    bio13 0.1 0.1
    bio1 0.1 1.5
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出版历程
  • 收稿日期:  2017-03-20
  • 刊出日期:  2018-03-20

基于MaxEnt模型的川续断气候适宜性分析

    通讯作者: 李逐波,教授
    作者简介: 尧聪(1992-),女,湖北咸宁人,硕士研究生,主要从事中药资源与开发研究
  • 1. 西南大学 药学院,重庆 400716
  • 2. 重庆市中药研究院,重庆 400065
基金项目:  重庆市科技平台与基地建设项目(cstc2014ptyjd10001)

摘要: 查询相关文献、国家数字植物标本馆和全球生物多样性信息数据库,收集川续断在全国的采样信息,以温度、降雨和海拔为指标,采用MaxEnt模型软件对川续断在全国的气候适宜性进行分析.研究结果表明,MaxEnt预测模型有效性高.影响川续断适宜性分布的主要气候因子为最暖季降水量、海拔、温度季节性变化的标准差、季节降水量变异系数、年均温范围和最干季平均温,适宜的取值区间分别为最暖季降水量为500~900 mm,海拔为1 800~4 300 m,温度季节性变化的标准差为40~75,季节降水量变异系数为65~105,年均温范围为21 ℃~30 ℃,最干季平均温度为-1 ℃~9 ℃.全国可划分为4个气候适宜等级,依照p<0.25为气候不适宜区;0.25≤p<0.48为气候较适宜区;0.48≤p<0.78为气候适宜区;p≥0.78为气候最适宜区的划分标准,川续断适宜生长区域主要集中在西南地区,包括云南、西藏、四川、贵州、重庆等省市.

English Abstract

  • 续断为川续断科植物川续断Dipsacus asper的干燥根,最早记载在《神农本草经》中,被列为上品,具有补肝肾、强筋骨、续折伤、止崩漏的功效[1-2].续断中主要含有三萜皂苷类、环烯醚萜苷类、生物碱类、酚酸类、挥发油类等化合物,其药理作用主要为抗骨质疏松、促进骨愈合、安胎、抗氧化、抗炎、抗肿瘤、抗心肌梗塞等[3-5].

    近年来,续断作为大宗常用中药材,是一些中成药如“仙灵骨葆胶囊”、“骨康胶囊”、“复方续断接骨丸”、“祛风止痛片”的主要原料,市场需求量巨大.课题组在全国第4次中药资源普查中,发现野生川续断资源破坏严重.另外,随着林业产权的改革,加上川续断原有生态环境的改变,川续断的生存空间严重不足,其分布区逐渐缩小.

    最大信息熵模型(MaxEnt)是一种基于最大熵理论提出的生态位模型,以物种分布区信息和多种环境数据为基础,通过数学模型模拟出此物种的适宜性,再计算环境数据,得出该物种在目标区域的存在概率值,判断该物种在此是否有分布.目前最常用的预测物种潜在分布的生态位模型有MaxEnt,GARP,ENFA,Bioclim,Domain等,其中MaxEnt (http://www.cs.princetion.edu/schapire/maxent)软件预测结果好、操作十分简单、运算速度非常快,在实用性和预测效果方面都比较突出.本文首次利用MaxEnt和ArcGIS技术进行川续断的气候适宜性分析,找出影响川续断分布的主要气候因子和适宜生长区域,为今后开展续断合理引种栽培提供科学依据.

  • 气候数据来源于世界气候数据库(http://www.worldclim.org/),坐标系为WGS84,栅格大小约为1 km2,为1960年至2010年监测数据的平均值,图层中的温度数值(℃)为实际数值×10.气候数据库包括了对植物生长具有重要影响的19项生物气候指标(表 1),适用于植物的气候适宜性分析.

  • 通过查询中国数字植物标本馆(http://www.cvh.org.cn/)、全球生物多样性信息数据库(http://www.gbif.org/)及文献检索,共得到川续断分布点103个(表 2),信息内容包括物种名、经纬度、海拔等,主要分布于重庆、四川、云南、甘肃、西藏、湖北等地,与第4次全国中药资源普查中发现的川续断分布区类似.

  • 将包括温度、降雨等19项生物气候指标及海拔等生态环境数据和川续断分布点经纬度数据文本(.csv格式)加载到MaxEnt(3.3.3k)软件中,软件运行参数设置为在环境参数设置中开启刀切法来检验各个气候因子的权重,设分布数据的25%随机抽取为测试集,其余为训练集,最大迭代次数为105,其他参数设置为软件默认值,采用受试者工作特征曲线(ROC)进行川续断分布模型预测结果精度评价,由于ROC曲线下面积(AUC)值不受阈值影响,因此ROC曲线分析法已经广泛地被用于评价物种潜在分布预测模型的准确性,且被认为是诊断试验的最佳评价指标,AUC值0.5~0.6为失败,0.6~0.7为较差,0.7~0.8为一般,0.8~0.9为好,0.9~1.0为非常好[6-7].

  • 选取20个气候因子和103个川续断采样点经纬度数据,根据MaxEnt模型多次迭代计算结果,选取贡献率之和超过90%的气候因子作为主要因子,同时根据参与建模的气候因子的不同值,对最大熵模型输出的物种存在概率的影响绘制单变量响应曲线,并分析各主要气候因子的适宜区间值.

  • 将MaxEnt模型运行的结果应用该软件进行栅格转化导入ArcMap中,得到川续断的生长适宜指数,然后采用人工分级方法分析,划出川续断适宜性分布区域.

  • 选用25%的分布数据作为检验数据集,其余为训练数据集,随机运行10次制作ROC曲线,进行气候适宜的分析模型计算结果精度评价,结果见图 1.横坐标1-Specificity(特异性)为假阳性率,纵坐标1-Omission(漏报率)为真阳性率,蓝色线条为检验集的ROC曲线,其AUC值为0.994,训练数据集AUC值也为0.994,均在0.9以上,表明模型模拟效果非常好,基于训练集计算的川续断生境适宜度的准确度很高[8-9].

  • 在MaxEnt建模过程中,不同气候因子对川续断适宜性分布的影响表现出较大差异,主要体现在建模贡献率和Jackknife分析结果上,具有贡献率的气候因子有13个,其余均为0;对川续断气候适宜性贡献率排名前6位的气候因子分别为bio18,alt,bio4,bio15,bio7和bio9,这6个气候因子对川续断的分布影响较大,贡献率之和达到98%,说明这6个变量是影响川续断分布的主要气候因子,见图 2表 3.

    从6种主要气候因子对预测结果的响应曲线来看,当存在概率大于0.5时,其对应的生态因子值较适合续断生长,因此各气候因子的适宜取值区间分别是最暖季降水量为500~900 mm,海拔为1 800~4 300 m,温度季节性变化的标准差为40~75,季节降水量变异系数为65~105,年均温范围为21 ℃~30 ℃,最干季平均温度为-1 ℃~9 ℃,见图 3.

  • 根据MaxEnt模型预测结果,运用ArcGIS加载分析得到川续断在全国的适宜分布区域图,可分为4级,如图 4所示,颜色从白色到蓝色区域表示生态适宜度值(p)依次递增,分别为p<0.25,0.25≤p<0.48,0.48≤p<0.78,p>0.78,其中p越大,越适宜川续断的生长.从图 4中可以看出,川续断在中国分布较为广泛,模型预测川续断适宜生长区域主要集中在西南地区,包括云南、西藏、四川、贵州、重庆等省市,而模型预测结果图中的陕西、甘肃、湖南、江西等地也被预测为川续断潜在分布区,但其p值较低,说明这些地方的生态环境也适合川续断的生长,但分布可能较少.在西藏南部、云南北部、贵州西部、四川西南部、重庆南部和湖北西部等蓝色区域为川续断的最佳适生区,且较为集中,这些地区主要为高海拔山地,可以选择合适地带开展川续断野生抚育或人工栽培.

  • 本试验利用MaxEnt模型和ArcGIS技术相结合,对川续断进行气候适宜性分析,研究发现川续断生长最适宜区主要集中在西藏南部、云南北部、贵州西部、四川西南部、重庆南部和湖北西部,陕西、甘肃、湖南、江西等地也有部分区域较为适宜.此外,MaxEnt模型的AUC值大于0.95,可以看出该模型具有很高的准确度和可信度.同时,结合各气候因子的影响,最终得到对川续断生长影响较大的气候因子及适宜值范围.影响川续断分布的主要气候因子是最暖季降水量、海拔、温度季节性变化的标准差、季节降水量变异系数、年均温范围和最干季平均温.其中,最暖季降水量的贡献率最大,西南地区降水充沛,尤其是夏季降水相对较多,大部分地区降水量都在500 mm以上.川续断花期在8~9月,果期在9~10月,最暖季是川续断生长旺盛的时期,也是川续断生长需水量最大的季节,表明最暖季降水量对川续断的生长和分布有着至关重要的影响,最暖季降水量的适宜值为500~900 mm,这既满足了川续断的需水量,也不至于降水量过多导致川续断块根腐烂.其次,影响川续断分布的因子为海拔,根据响应曲线可知,川续断分布海拔的适宜值为1 800~4 300 m,文献报道川续断产于我国四川稻城、黑水、金川、康定、冕宁、木里、盐边,海拔2 400~3 900 m; 西藏察隅、错那、亚东、林芝,海拔2 600~3 200 m; 云南德钦、会泽、鹤庆、大理、丽江,海拔1 920~3 800 m,各地海拔均基本在适宜范围1 800~4 300 m之内.从川续断的分布来看,川续断适宜性指数大于78%的地区主要集中在西藏南部、云南北部、贵州西部、四川西南部、重庆南部和湖北西部,这些地区地势较高,多为山地且气候湿润,表明了川续断喜温暖湿润较凉爽的气候.此外,温度季节性变化的标准差,季节降水量变异系数,年均温范围和最干季平均温等气候因子均表明川续断生长环境的温度和降水对其分布具有不同的影响.野生川续断的分布一般比较分散,但也有成片分布的,其空间分布为集群分布,对环境的适应能力强,群落结构相对稳定,通过分布情况发现川续断喜温暖湿润较凉爽的气候,以山地气候最适宜,最暖季降水量为500~900 mm,海拔1 800~4 300 m,年平均气温在21 ℃~30 ℃之间,适于土层深厚、肥沃、疏松的土壤栽培.本试验预测的川续断适生区气候特点与其实际生境情况较为接近,因此该方法有效性较高.

    影响预测结果准确度的主要因素是选取的生态因子和川续断的分布点,川续断分布点来源于全球生物多样性信息数据库和国家数字植物标本馆,涵盖了四川、云南、西藏及重庆等主要分布产区,与第4次全国中药资源普查中发现的川续断分布区类似,因此本试验所用的分布点数据代表性好.本试验是基于气候等因子数据模拟计算川续断在自然条件下的分布,可能与川续断的实际种植区存在一定差距.一方面是由于该研究只选取了海拔和气候因子进行预测,而影响川续断生长的生态因子并不只有这些因子; 另一方面是由于川续断的实际种植区受环境、经济等因素的影响.由于药用植物次生代谢产物累积所需的生态环境与其生长所需的生境可能不一致[10],所以还应该对川续断的品质适宜性区划进行研究以确定续断药材的最佳种植区.

参考文献 (10)

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