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考虑DAAs治疗的丙肝病毒RNA模型的全局稳定性分析

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贾璐, 张国洪. 考虑DAAs治疗的丙肝病毒RNA模型的全局稳定性分析[J]. 西南大学学报(自然科学版), 2021, 43(5): 83-87. doi: 10.13718/j.cnki.xdzk.2021.05.011
引用本文: 贾璐, 张国洪. 考虑DAAs治疗的丙肝病毒RNA模型的全局稳定性分析[J]. 西南大学学报(自然科学版), 2021, 43(5): 83-87. doi: 10.13718/j.cnki.xdzk.2021.05.011
JIA Lu, ZHANG Guo-hong. Global Stability Analysis of an HCV RNA Model Considering DAAs Treatment[J]. Journal of Southwest University Natural Science Edition, 2021, 43(5): 83-87. doi: 10.13718/j.cnki.xdzk.2021.05.011
Citation: JIA Lu, ZHANG Guo-hong. Global Stability Analysis of an HCV RNA Model Considering DAAs Treatment[J]. Journal of Southwest University Natural Science Edition, 2021, 43(5): 83-87. doi: 10.13718/j.cnki.xdzk.2021.05.011

考虑DAAs治疗的丙肝病毒RNA模型的全局稳定性分析

  • 基金项目: 国家自然科学基金项目(11701472, 11871403)
详细信息
    作者简介:

    贾璐,硕士研究生,主要从事生物数学及动力系统理论及其应用研究 .

    通讯作者: 张国洪,副教授
  • 中图分类号: O175

Global Stability Analysis of an HCV RNA Model Considering DAAs Treatment

  • 摘要: 本文研究了一个考虑DAAs治疗的丙肝病毒RNA动力学模型. 通过理论分析和数值模拟发现模型的全局动力学性态主要取决于基本再生数R0,即当R0<1时,边界平衡点全局渐近稳定,病毒灭绝;当R0>1时,正平衡点全局渐近稳定,病毒持续生存. 由R0的表达式知DAAs治疗在一定条件下可以作为抑制丙肝病毒复制的有效手段.
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  • [1] WHO. Guidelines for the Screening, Care and Treatment of Persons with Chronic Hepatitis C Infection [EB/OL]. (2016-4) [2019-10-07]. https://apps.who.int/iris/handle/10665/205035.
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出版历程
  • 收稿日期:  2019-11-07
  • 刊出日期:  2021-05-20

考虑DAAs治疗的丙肝病毒RNA模型的全局稳定性分析

    通讯作者: 张国洪,副教授
    作者简介: 贾璐,硕士研究生,主要从事生物数学及动力系统理论及其应用研究
  • 西南大学 数学与统计学院,重庆 400715
基金项目:  国家自然科学基金项目(11701472, 11871403)

摘要: 本文研究了一个考虑DAAs治疗的丙肝病毒RNA动力学模型. 通过理论分析和数值模拟发现模型的全局动力学性态主要取决于基本再生数R0,即当R0<1时,边界平衡点全局渐近稳定,病毒灭绝;当R0>1时,正平衡点全局渐近稳定,病毒持续生存. 由R0的表达式知DAAs治疗在一定条件下可以作为抑制丙肝病毒复制的有效手段.

English Abstract

  • 慢性丙型肝炎病毒(HCV)感染在全球影响约1.3亿至1.5亿人,是肝硬化和肝癌的主要原因[1]. 干扰素和利巴韦林的治疗只能使不到50%的患者消除病毒[2]. 为了提高HCV的治愈率,新治疗方案集中在直接抗病毒药物(DAAs)的开发上. 为了研究DAAs治疗的效果,科学家们开发并改进了区分和量化丙肝病毒RNA正链和负链的新方法. 一些考虑丙肝病毒RNA正链和负链的动力学模型被构建出来研究DAAs治疗下的丙肝病毒动力学性态. 特别地,文献[3-5]考虑了DAAs治疗对丙肝病毒RNA正链动力学性态的影响;文献[6]同时考虑了丙肝病毒RNA的正链和负链,但其没有区分RNA正链分别用于翻译和复制的情况;文献[7]中的模型同时考虑了丙肝病毒RNA的正链和负链,并区分了用于翻译和复制的RNA正链,但其常微分方程模型没有考虑DAAs治疗,同时对相关模型的理论分析还非常不完整. 基于上述分析,本文在文献[7]模型的基础上结合DAAs治疗得到如下动力学模型:

    其中:Rt表示用于翻译的丙肝病毒RNA正链的数量;RcRm分别表示复制复合物中用于复制的丙肝病毒RNA正链、负链的数量;μtRt的自然衰退率,RcRm的自然衰退率均是μcRc可以从复制复合物和膜质网中穿出到细胞质中,以θ速率变为RtRt从细胞质进入膜质网并与复制复合物的蛋白质相互作用,并以σ的速率变为RcRcRt可以组装进入病毒粒子中,并以ρ的速率分泌出病毒粒子;在复制复合物中,Rm可以通过最大速率r复制Rc形成,Rc以速率α通过复制Rm形成;εs表示药物治疗对病毒分泌的影响,εα表示药物治疗对Rc的影响,εr表示药物治疗对Rm的影响,εi=1(i=sαr)对应于100%有效的药物,εi=0(i=sαr)对应于完全无效的药物,所以一般假设0<εi<1(i=sαr);kt表示药物治疗改变Rt降解速率的效果,kc表示药物治疗改变RcRm降解速率的效果,一般假设ki≥1(i=tc). 假定宿主因子限制RNA负链的复制,因此当达到最大数量Rmax时,复制按照logistic生长定律减慢.

  • 依据模型生物意义,我们给定系统(1)非负初始条件:

    定理1  对于给定的初始条件(2),系统(1)的所有解都是非负的,且在$ \mathbb{R}_{+}^{3}$中最终有界.

      首先证明系统(1)解的非负性. 假设在某一时刻t1,某个变量率先取到0,其余变量为正,不妨设Rt(t1)=0,Rc(t1)>0,Rm(t1)>0. 则由系统(1)的第1个方程可得:

    Rt将恢复正性.

    假设在某一时刻t2,某2个变量率先取到0,其余变量为正,不妨设Rt(t2)=Rm(t2)=0,Rc(t2)>0. 则由系统(1)的第2个方程可得:

    假设在某一时刻t3t2,有Rc首次取到0,即Rc(t3)=0. 则由系统(1)可得:

    从而RtRm将恢复正性.

    假设在某一时刻t4,3个变量同时取到0,即Rt(t4)=Rm(t4)=Rc(t4)=0,此时有

    显然RtRmRc将一直为0. 重复上述证明过程,可得系统(1)解的非负性.

    下面证明系统的耗散性. 由解的非负性及系统(1)第3个方程易知:

    将系统(1)第1个方程和第2个方程相加可得:

    进而由解的非负性可以得到:

    其中d=min{ktμtkcμc}. 再由比较原理可得:

    从而系统的耗散性得证. 定理证毕.

    由定理1的证明,可以得到系统(1)存在如下不变区域:

  • 易见系统(1)总是存在边界平衡点E0(0,0,0). 计算可得基本再生数$R_{0}=\frac{b \theta \sigma+s m w}{b m n} $,其中m=σ+(1-εs)ρ+ktμts=(1-εα)αn=θ+(1-εs)ρ+kcμcw=(1-εr)rb=kcμc. 则由简单计算可知当R0>1时,系统(1)存在唯一的正平衡点E*(Rt*Rc*Rm*),其中

    对于相关平衡点的局部稳定性,我们有如下定理:

    定理2  (i)当R0<1时,边界平衡点E0(0,0,0)局部渐近稳定;

    (ii) 当R0>1时,正平衡点E*(Rt*Rc*Rm*)局部渐近稳定.

      (i)系统(1)在E0处的特征方程为

    其中

    注意到θnσm,可得mn-θσ>0. 同时当R0<1时,有bn-ws>0. 从而易知ai>0,i=1,2,3. 进一步计算可得:

    再次由mn-θσ>0,bn-ws>0,可得a1a2-a3>0. 从而根据Routh-Hurwitz稳定性判据可知,当R0<1时,特征方程(4)的所有根均具有负实部,从而知边界平衡点E0(0,0,0)是局部渐近稳定的.

    (ii) 系统(1)在E*处的特征方程为

    其中

    易知bi>0,i=1,2,3. 进一步计算可得:

    mn-θσ>0,可知b1b2-b3>0. 从而根据Routh-Hurwitz稳定性判据可知,当R0>1时,特征方程(5)的所有根均具有负实部,从而知正平衡点E*(Rt*Rc*Rm*)局部渐近稳定. 定理证毕.

  • 定理3  (i)当R0<1时,边界平衡点E0(0,0,0)全局渐近稳定;

    (ii) 当R0>1时,正平衡点E*(Rt*Rc*Rm*)全局渐近稳定.

      (i)根据上述定理1和定理2,只需证明平衡点的全局吸引性. 构造如下Lyapunov函数:

    对函数V1(t)沿系统(1)的解求导可得

    R0<1时,易见$\frac{\mathrm{d} V_{1}(t)}{\mathrm{d} t} \leqslant 0 $$\frac{\mathrm{d} V_{1}(t)}{\mathrm{d} t}=0 $仅当Rc=0时成立. 将Rc=0代入系统(1)第1个方程和第3个方程,可以得到Rt→0及Rm→0. 从而由Lyapunov-LaSalle不变原理可知,当R0<1时,无病平衡点E0(0,0,0)全局吸引,从而全局渐近稳定.

    (ii) 令g(x)=x-1-lnx(x>0). 构造如下Lyapunov函数:

    对函数V2(t)沿系统(1)正解求导,并利用正平衡点E*满足的等式可得:

    注意到当x>0时,g(x)≥g(1)=0. 由此可知当R0>1时$\frac{\mathrm{d} V_{2}(t)}{\mathrm{d} t} \leqslant 0 $,且$\frac{\mathrm{d} V_{2}(t)}{\mathrm{d} t}=0 $仅当Rt=Rt*Rm=Rm*Rc=Rc*时成立. 从而根据Lyapunov-LaSalle不变原理,当R0>1时,正平衡点E*(Rt*Rc*Rm*)是全局渐近稳定的.

    理论研究表明,系统(1)的全局动力学性态完全由基本再生数R0决定,从而为了研究DAAs治疗对疾病控制的影响,只需知道DAAs治疗各参数对R0的影响. 特别地,由R0的如下表达式

    可知当通过DAAs治疗使得治疗相关参数εs增大时,即减小分泌病毒的速率时,会使得R0增大,此时可能会增加细胞内病毒RNA的浓度;当使得相关参数εαεrktkc增大时,即减小RcRm之间的复制速率以及增大RtRcRm的降解速率时,会使得R0减小,从而有利于疾病控制.

  • 为了探究DAAs治疗对丙肝病毒RNA动力学性态的影响,取定一组参数ρ=0.1,θ=1.2,σ=0.1,μt=24,μc=1.05,α=30,r=3.18,Rmax=100,kt=kc=1,使εsεαεr作为控制参数而变化. 当εs=εα=εr=0.01时,可以计算出基本再生数R0=37.911 5,此时系统(1)存在平衡点Rt*=61.177 3,Rc*=1 233.690 2,Rm*=97.367 7且是全局渐近稳定的(图 1(a)),可见此时治疗效果不佳;当εs=0.998,εα=0.99,εr=0.37时,可以计算出基本再生数R0=0.256 6,知系统(1)的边界平衡点是全局渐近稳定的(图 1(b)),RtRcRm最终趋于零,说明此时采取的治疗十分有效. 由此可见,系统(1)可以用来研究DAAs治疗抑制丙肝病毒复制的效果.

参考文献 (7)

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