山羊奇异变形杆菌毒力因子zapA基因的克隆及蛋白结构预测
Cloning and Prediction of Protein Structure of Virulence Factors zapA Gene of Proteus mirabilis from Goat
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摘要: 为了研究山羊奇异变形杆菌毒力因子,克隆zapA基因和预测推导的蛋白结构.采用PCR方法,对山羊奇异变形杆菌zapA基因进行扩增、克隆及序列测定;利用生物信息学软件预测推导zapA蛋白的信号肽、跨膜区、二级结构及B细胞抗原表位.结果表明:zapA基因长为1476 bp,编码491个氨基酸,与参考株的核苷酸序列同源性为99.59,,氨基酸同源性为99.59,; zapA蛋白存在信号肽,无跨膜区,B细胞表位可能位于69-71,78-84,136-139,197-199,353-356,371-373和472-474氨基酸区域内或附近.该试验为奇异变形杆菌zapA蛋白的表达及基因工程疫苗的研制提供了理论基础.
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关键词:
- 奇异变形杆菌,zapA基因,蛋白结构
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