运用ITS克隆文库解析桉树种植地土壤真菌群落多样性

谭燕,何文高,米瑶,朱琳慧,黄靖,李关荣,胡凯

西南师范大学学报(自然科学版)

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运用ITS克隆文库解析桉树种植地土壤真菌群落多样性

谭燕,何文高,米瑶,朱琳慧,黄靖,李关荣,胡凯. 运用ITS克隆文库解析桉树种植地土壤真菌群落多样性[J]. 西南师范大学学报(自然科学版), 2013, 38(9).

引用本文:

谭燕,何文高,米瑶,朱琳慧,黄靖,李关荣,胡凯. 运用ITS克隆文库解析桉树种植地土壤真菌群落多样性[J]. 西南师范大学学报(自然科学版), 2013, 38(9).

On Fungus Diversity of Eucalyptus Soil by ITS Cloning Library[J]. Journal of Southwest China Normal University(Natural Science Edition), 2013, 38(9).

Citation:

On Fungus Diversity of Eucalyptus Soil by ITS Cloning Library[J]. Journal of Southwest China Normal University(Natural Science Edition), 2013, 38(9).

运用ITS克隆文库解析桉树种植地土壤真菌群落多样性

谭燕,何文高,米瑶,朱琳慧,黄靖,李关荣,胡凯

西南大学农学与生物科技学院药用植物研究所,重庆,400716,重庆文理学院林学与生物科学学院,重庆永川,402168

On Fungus Diversity of Eucalyptus Soil by ITS Cloning Library

摘要: 为了研究桉树种植地土壤真菌群落多样性,该试验利用ARDRA和ITS系列分析相结合的方法,提取桉树土壤微生物DNA,构建真菌的ITS克隆文库进行阳性克隆检测,分析显示含有ITS序列的阳性克隆子95个,并归类为13个不同的类群OTUs,随机挑取各类群进行测序,构建系统发育进化树.结果表明:用限制性内切酶HinfⅢ进行酶切鉴定,检测到13种不同的分类操作单位(OTUs),其中有3种为单一基因型(OTUs),占总数的23.1，.根据库容(coverage)公式计算得出文库的库容值为97.5，.采用ARDRA酶切图谱和测序结果分析,桉树人工林地土壤真菌群落由Ant fungus garden metagenome,Freshwater metagenome,Coral metagenome,Marine metagenome 4大类群组成,这为进一步研究桉树人工林土壤微生物及环境质量的变化提供了基础资料,并为西南地区桉树与土壤微生物数量、群落之间的变化关系提供了可靠的依据.
- 桉树,ITS,ARDRA,群落结构
- Eucalyptus，ITS，ARDRA，community structure .

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运用ITS克隆文库解析桉树种植地土壤真菌群落多样性

谭燕,何文高,米瑶,朱琳慧,黄靖,李关荣,胡凯

西南大学农学与生物科技学院药用植物研究所,重庆,400716,重庆文理学院林学与生物科学学院,重庆永川,402168

关键词:

桉树,ITS,ARDRA,群落结构

摘要: 为了研究桉树种植地土壤真菌群落多样性,该试验利用ARDRA和ITS系列分析相结合的方法,提取桉树土壤微生物DNA,构建真菌的ITS克隆文库进行阳性克隆检测,分析显示含有ITS序列的阳性克隆子95个,并归类为13个不同的类群OTUs,随机挑取各类群进行测序,构建系统发育进化树.结果表明:用限制性内切酶HinfⅢ进行酶切鉴定,检测到13种不同的分类操作单位(OTUs),其中有3种为单一基因型(OTUs),占总数的23.1，.根据库容(coverage)公式计算得出文库的库容值为97.5，.采用ARDRA酶切图谱和测序结果分析,桉树人工林地土壤真菌群落由Ant fungus garden metagenome,Freshwater metagenome,Coral metagenome,Marine metagenome 4大类群组成,这为进一步研究桉树人工林土壤微生物及环境质量的变化提供了基础资料,并为西南地区桉树与土壤微生物数量、群落之间的变化关系提供了可靠的依据.