重庆荣昌犬钩虫ITS及5.8S rDNA的克隆及序列分析

黄丽,周荣琼,林洁,谭燕财,马光旭,敖冯虎

西南师范大学学报(自然科学版)

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重庆荣昌犬钩虫ITS及5.8S rDNA的克隆及序列分析

黄丽,周荣琼,林洁,谭燕财,马光旭,敖冯虎. 重庆荣昌犬钩虫ITS及5.8S rDNA的克隆及序列分析[J]. 西南师范大学学报(自然科学版), 2013, 38(11).

引用本文:

黄丽,周荣琼,林洁,谭燕财,马光旭,敖冯虎. 重庆荣昌犬钩虫ITS及5.8S rDNA的克隆及序列分析[J]. 西南师范大学学报(自然科学版), 2013, 38(11).

On Cloning and Sequence Analysis of ITS and 5.8S rDNA of Ancylostoma Caninum in Rongchang, Chongqing[J]. Journal of Southwest China Normal University(Natural Science Edition), 2013, 38(11).

Citation:

On Cloning and Sequence Analysis of ITS and 5.8S rDNA of Ancylostoma Caninum in Rongchang, Chongqing[J]. Journal of Southwest China Normal University(Natural Science Edition), 2013, 38(11).

重庆荣昌犬钩虫ITS及5.8S rDNA的克隆及序列分析

黄丽,周荣琼,林洁,谭燕财,马光旭,敖冯虎

西南大学(荣昌校区)动物医学系,重庆,402460

On Cloning and Sequence Analysis of ITS and 5.8S rDNA of Ancylostoma Caninum in Rongchang, Chongqing

摘要: 利用聚合酶链式反应(PCR)扩增犬钩虫rDNA的ITS及5.8S序列,然后将PCR扩增产物回收纯化后连接到pMDTM 19-T载体上进行克隆.重组质粒通过菌落PCR鉴定,将阳性重组质粒进行序列测定并且进行序列分析.结果显示,5株犬钩虫荣昌分离株ITS序列的总长为833 bp～834 bp.ITS-1序列总长无差异,但存在个别碱基的差异;5.8S序列总长与序列均无差异;ITS-2序列总长存在差异(221 bp～222 bp).通过与GeneBank上报道的其他钩虫的ITS序列进行相似性分析,发现犬钩虫荣昌分离株(RCF)与犬钩虫广州分离株相似性最高,为99.9，,与美国北海狮弯口属钩口线虫ITS序列的相似性最低,为86.1，.表明ITS可作为分子标记用于犬钩虫种属以及种间的鉴定.该研究结果旨在为今后犬钩虫的分类鉴定、种群遗传关系、分子流行病学调查以及对该病的防治等方面的更深入研究奠定基础.
- 犬钩虫,内转录间隔区(ITS),PCR,序列分析
- Ancylostoma caninum，internal transcribed spacer(ITS)，PCR，sequence analysis .

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重庆荣昌犬钩虫ITS及5.8S rDNA的克隆及序列分析

黄丽,周荣琼,林洁,谭燕财,马光旭,敖冯虎

西南大学(荣昌校区)动物医学系,重庆,402460

关键词:

犬钩虫,内转录间隔区(ITS),PCR,序列分析

摘要: 利用聚合酶链式反应(PCR)扩增犬钩虫rDNA的ITS及5.8S序列,然后将PCR扩增产物回收纯化后连接到pMDTM 19-T载体上进行克隆.重组质粒通过菌落PCR鉴定,将阳性重组质粒进行序列测定并且进行序列分析.结果显示,5株犬钩虫荣昌分离株ITS序列的总长为833 bp～834 bp.ITS-1序列总长无差异,但存在个别碱基的差异;5.8S序列总长与序列均无差异;ITS-2序列总长存在差异(221 bp～222 bp).通过与GeneBank上报道的其他钩虫的ITS序列进行相似性分析,发现犬钩虫荣昌分离株(RCF)与犬钩虫广州分离株相似性最高,为99.9，,与美国北海狮弯口属钩口线虫ITS序列的相似性最低,为86.1，.表明ITS可作为分子标记用于犬钩虫种属以及种间的鉴定.该研究结果旨在为今后犬钩虫的分类鉴定、种群遗传关系、分子流行病学调查以及对该病的防治等方面的更深入研究奠定基础.